Mientras que IS-IS opera en la parte superior de la capa 2, OSPF opera en la capa 3.
IS-IS es un protocolo de capa 3 con su propio paquete de capa 3, mientras que OSPF utiliza un paquete IP.
La Fragmentación es responsabilidad de IS-IS, sin embargo en OSPF la fragmentación es responsabilidad de IP.